Построен при Санкт-Петербургском подворье Иоанно-Предтеченского Леушинского женского монастыря по благословению св. прав. Иоанна Кронштадтского игуменией Таисией Леушинской по проекту арх. Н. Н. Никонова. 

Главный престол во имя св. Ап. и Ев. Иоанна Богослова (престольный праздник 21 мая и 9 октября) освящен 21 ноября 1894 епископом Нарвским Никандром в сослужении о. Иоанна Кронштадтского. 

ретий престол – св. Иоанна Кронштадтского – оставался не освященным до 1917 в ожидании канонизации о. Иоанна.

Храм был возвращен только в 2000.

В храме находится новый канонический список иконы, написанный в 2012 году, который был заказан в благодарность за исцеление одной из прихожанок храма. Икона написана Ростиславом Гирвелем, такие же списки находятся в Сербии и Польше.

город Санкт-Петербург ул. Некрасова, 31